การป้องกันแมลงวันทองทำลายผลฝรั่งควรจะใช้กระดาษซีเมนต์ หรือกระดาษหนังสือพิมพ์ห่อผลฝรั่งจะช่วยได้มาก  การกำจัดแมลงวันทองควรจะร่วมมือกันกำจัดพร้อมกันทุกสวน  ในปัจจุบันนิยมใช้  เมททิวยูจินอลหรือกลิ่นเสน่หาของเพศเมีย  ซึ่งเป็นสารที่ดึงดูดแมลงวันทองตัวผู้ให้เข้ามาตายในกับดัก  เมื่อแมลงวันตัวผู้ลดจำนวนลงไปเรื่อย ๆ ตัวเมียไม่ได้รับการผสมพันธุ์โอกาสที่แมลงวันทองจะแพร่ขยายพันธุ์ก็ลดน้อยลงมีผลให้ผลไม้นานาพันธุ์ถูกทำลายน้อยลง  การกำจัดด้วยวิธีนี้เป็นวิธีที่ดีที่สุดคือ ผู้ใช้ปลอดภัยจากสารพิษฆ่าแมลงศัตรูพืชและสามารถลดจำนวนแมลงวันทองลงไปได้มาก ประเภทดูดซึมฉีดพ่นเป็นระยะ ๆ ถ้าใช้สารพิษฆ่าแมลง 7-10 วัน ก็จะช่วยได้มาก แต่ควรระมัดระวังและป้องกันตนเองในขณะที่ฉีดพ่นให้มากและควรจะบันทึกวันที่ฉีดพ่นสารพิษไว้ด้วย  เพื่อสะดวกในการเก็บผล  ถ้าเก็บผลไปรับประทานหรือจำหน่ายในช่วงที่สารพิษยังไม่สลายตัวจะเป็นอันตรายแก่ผู้บริโภค  สำหรับผลฝรั่งที่เน่าเสียควรเก็บไปทำลายเสียให้หมด เพราะหนอนของแมลงวันทองจะชอนไช กินเนื้อฝรั่งอยู่ 8-9 วัน  จึงตีจากไปเป็นดักแด้  อยู่ในดินประมาณ 10 วัน ก็กลายเป็นแมลงวันทองตัวเต็มวัย